インストール (2) OneAPI リビルド

概要

  • PHITSをIntel OneAPI環境下で再ビルドし、MPIやOpenMPに対応した実行ファイルを構築する．

  • PHITSのインストールでは、 (1) ライブラリや反応断面積データベースのディプロイ、(2) コンパイル、 (3) パス設定などを実施しているはず．

  • 既存インストールのPHITSで、srcディレクトリ内のMakefileを編集し、再コンパイルすれば、 OneAPIコンパイラ（ifx）を用いたPHITSへ変更可能 ．


手順概要

  1. OneAPIをインストール（Fortranのページ参照）．

  2. phits/src/にて、 makefile を編集．

  3. makeを実行．

  4. 作成された実行ファイルをphits/bin/へコピーして、phits.shの対象実行ファイルを書き換える．

  5. 上記、2-4は、OMP, MPI, 両方なしの３種類で作成する．


Makefileの編集

phits/src/makefile 内のビルド構成を変更する．

  • 既存の LinIfort セクション ( ifeqでマッチしている箇所 )を複製し、LinuxOneAPI の新たなセクションを作成する．

  • FC=mpiifort を FC=mpiifx に，または FC=ifort を FC=ifx に変更する．

  • LinIfortで検索して、引っかかる部分は、LinuxOneAPIにもマッチするように、適宜複製．(面倒であれば、LinIfortのFCを置き換えても良い．)

  • 必要に応じて FFLAGS も適宜調整する（例：-O3 -xHost -heap-arrays など）．


USEOMP, USEMPI の組み合わせ

以下の3パターンをそれぞれ make 時に定義してビルドする：

  • USEOMP=0 USEMPI=0：シングルスレッド版（逐次実行用）

  • USEOMP=1 USEMPI=0：OpenMP並列化版

  • USEOMP=0 USEMPI=1：MPI並列化版

ビルド例：

make -j 8 ENVFLAGS=LinuxOneAPI USEOMP=0 USEMPI=0
make -j 8 ENVFLAGS=LinuxOneAPI USEOMP=1 USEMPI=0
make -j 8 ENVFLAGS=LinuxOneAPI USEOMP=0 USEMPI=1

実行ファイルの配置

ビルドされた実行ファイルは、phits/ ディレクトリ下に次のようなファイル名で出力される：

  • phits_LinuxOneAPI （シングルスレッド版）

  • phits_LinuxOneAPI_OMP （OpenMP版）

  • phits_LinuxOneAPI_MPI （MPI版）

これらを phits/bin ディレクトリにコピーする．


phits.sh の修正

PHITS起動スクリプト phits/bin/phits.sh を編集し、実行対象を以下のように変更する：

PHITS_SINGLE_EXE=phits_LinuxOneAPI
PHITS_OMP_EXE=phits_LinuxOneAPI_OMP
PHITS_MPI_EXE=phits_LinuxOneAPI_MPI

これにより、phits.sh 実行時に OneAPI + MPI 版 PHITS を使用するようになる．


補足

OneAPI の環境を有効にするには、以下の実行が必要：

source /opt/intel/oneapi/setvars.sh

makefileがわかってない場合は、コンパイラの位置として、絶対パスを指定するなどする．