PBS を使用したジョブ管理 ( キュー )¶
ジョブ管理パッケージ ( PBS, OpenPBS, Torqueについて )¶
キューを使用して、ジョブスケジューリングするソフトウェアパッケージ
PBS (NASAが当初開発)
OpenPBS ( オープンソースとしてPBSから派生 )
Torque ( かつてオープンソースとしてPBSから派生、現在はクローズドソース)
投入スクリプト 記載例¶
#!/bin/bash
#PBS -N sample ### ジョブ名
#PBS -l select=2:ncpus=8:mpiprocs=8 ### 2ノード、各ノード8コア (適宜変更)
#PBS -l walltime=72:00:00 ### 実行時間の上限 ( 72時間 )
#PBS -j oe ### 標準出力とエラー出力を統合
#PBS -o stdout ### 標準出力ファイル名
#PBS -q queue_001 ### 使用するキュー名 (各キューシステム参照)
### --- ジョブの開始 --- ###
echo "Job started on $(hostname) at $(date)"
### --- 準備 --- ###
cd $PBS_O_WORKDIR ### ジョブ投入したディレクトリに移動 ( PBS 予約の環境変数)
EXEC=./a.out ### 実行MPIプログラムのパス
#
# module load mpi ### 必要なモジュールをロード
#
### --- 実行 --- ###
mpiexec -np 4 $(EXEC) ### 総プロセス数 (-np) を指定 (例: 16プロセス)
### --- ジョブの終了 --- ###
echo "Job finished on $(hostname) at $(date)"
